整地的好坏直接影响出苗率和苗期水分管理的难度。主要有3个问题需要注意，首先是深翻耕，许多人为了抢播期，多年不深翻耕，车辆和机具的碾压使下层土壤紧实，而播种前的浅旋耕仅改善了表土，这样的土壤条件会引起多种问题，有的基地甚至出现了起草皮时重型卡车车辙形状的缺苗，这就是局部土壤过度紧实的结果。由此还会引起排水不畅，病虫害多，土壤保水能力差且紧实度不均匀等问题，为苗期管理造成了很大的困难。所以建议至少每2年至3年深耕翻或重耙一次，充分改善下层土壤的渗透和通气性，并能使中上层土壤的质地更均匀。
整地中的另一个主要问题是平整度，不平整的土地会导致灌溉水分布不匀并形成地表径流，直接影响出苗的均匀度和苗床水分均匀，这主要是由于浇水时种子易被冲走，苗床也很难保持一致的水分状况，结果很容易形成缺苗秃斑，所以每次播种前必须认真平整。
整地中的最后一个问题是大土块，特别是土壤质地粘重的地块，大土块的存在会严重影响播种和出苗的均匀度，应在土壤微湿时用圆盘耙或棘轮镇压器等机械充分破碎。